Ранние памятники культа Зевса на Боспоре чрезвычайно скудны. Несколько граффити-посвящений IV в. до н. э. свидетельствуют о его культе здесь в качестве Спасителя. Как и в других причерноморских городах, этот бог почитался в частной сфере преимущественно в качестве покровителя пиршеств — симпосиев. С III в. до н. э., судя по надписям, Зевс Спаситель («Со-тер») стал играть более важную роль в религиозной жизни боспорян.
В официальных культах боспорских городов, а затем в государственном пантеоне Боспорского царства на всем протяжении его существования кардинальные изменения произошли только в период драматических событий I в. до н. э. — I в. н. э. Со смертью последнего представителя династии Спартокидов, правившей на Боспоре с 438 г. до конца II в. до н. э., культ ее главного покровителя Аполлона Врача уходит в тень. После владычества понтийского царя Митридата VI, который имел прозвище Дионис, и последовавшего за этим смутного времени с I в. н. э. верховным божеством всех боспорян становится Афродита Урания (напомним, что ранее эта богиня безраздельно царила только на Азиатской стороне Боспора). Одновременно на рубеже эр увеличивается количество государственных культов несравненно меньшего значения, в частности, за счет греческих Гермеса и Гелиоса, а также малоазийского Мена и египетских богов Исиды и Сераписа. Отличительной чертой культурной и общественной жизни боспорских городов в позднюю эпоху было существование там фиасов — религиозных союзов, объединявших поклонников какого-нибудь одного бога. Фиасы заботились о выполнении религиозных обрядов, об организации празднеств, о погребении своих членов, воспитании детей и т. п. Наибольшее распространение получили фиасы, члены которых поклонялись Богу Высочайшему (его имя никогда не называлось в надписях). Этот культ вобрал в себя черты иудейского Яхве, эллинского Зевса, малоазийского Сабазия и ряда других культов, в том числе и местного происхождения.
Нужно отметить, что первые века новой эры не только в религиозной жизни, но и во всех прочих областях культуры Боспора характеризуются усилением влияния варварских элементов. Те же явления варваризации наблюдаются в это время в Ольвии, а также, хотя и в меньшей степени, в Херсонесе.
С первого взгляда бросающееся в глаза великолепие сохранившихся погребальных сооружений боспорян свидетельствует о том, что забота о посмертном существовании имела для них исключительное значение. Для погребения знати, как правило, сооружались каменные склепы либо на поверхности земли, либо под землей. В первом случае поверх гробницы насыпали земляной курган. Подкурганные погребения более характерны для варваров, в то время как греки обычно хоронили своих покойников в простых грунтовых могилах.
Боспорские погребальные склепы, являющиеся замечательными памятниками архитектуры, обычно состоят из одного или двух прямоугольных помещений, к которым вел дромос (коридор). Их стены и перекрытия складывали из больших каменных тесаных блоков (чаще всего из керченского известняка, легко поддающегося обработке). Блоки перекрытия выступали один над другим, создавая вид уступчатого шатра. С III в. до н. э. началось строительство склепов с полуцилиндрическим сводом.